Ученый Иннополиса изобрел сверхбыстрый алгоритм для создания лекарств

(Казань, 5 августа, «Татар-информ»). Профессор университета «Иннополис» Ярослав Холодов создал сверхбыстрый алгоритм моделирования белковых взаимодействий, способный проводить вычисления параллельно, пишут «Известия».

Изобретение поможет отказаться от дорогих лабораторных экспериментов и полностью использовать компьютерное моделирование. На разработку алгоритма потребовалось более двух лет, а использовать его можно для увеличения скорости разработки лекарств, он также поможет разобраться в процессах внутри любых живых организмов.

«Теперь можно провести исследование и изобрести лекарство в десятки и сотни раз быстрее, включая лекарства от ВИЧ, рака, да и вообще любых заболеваний, – рассказал Ярослав Холодов. – Алгоритм также позволяет анализировать действия вирусов или, например, что происходит внутри растений. Вообще изучение белок-белковых взаимодействий привлекает большое внимание научного мира».

На разработку нового метода ученых подтолкнула необходимость решения двух важных задач. Во-первых – найти возможность быстрее доставлять лекарство до больных клеток, во-вторых – увеличить скорость вычислений и при этом снизить затраты на исследования.

Существующие сейчас программы не могут выполнять параллельное моделирование, они только могут проводить последовательный мониторинг конфигураций независимо друг от друга. Поэтому до сих пор исследование занимало несколько дней, что требовало больших мощностей суперкомпьютеров. С помощью нового алгоритма такое же исследование займет до 15 минут. Кроме того, новый алгоритм благодаря параллельным вычислениям позволяет находить дополнительные взаимосвязанные функции взаимодействий разных белков.